RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 NBPF11Q86T75 865 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 HSCBQ8IWL3 235 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 PDHXO00330 501 aa18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 FLOT1O75955 427 aa18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 STAT2P52630 851 aa18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SREBF2Q12772 1141 aa18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 FEM1BQ9UK73 627 aa18.27■□□□□ 0.52
CCL25-201ENST00000253451 MYH6P13533 1939 aa18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PPFIA3O75145 1194 aa18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 SYDE2Q5VT97 1194 aa18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 BTNL9Q6UXG8 535 aa18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 FAM160B2Q86V87 743 aa18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 KIFC2Q96AC6 838 aa18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CYTH3O43739 400 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PLA2G6O60733 806 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 GNAQP50148 359 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 SNAP25P60880 206 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 FUT2Q10981 343 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 NTRK3Q16288 839 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 IFNL1Q8IU54 200 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 ATG4CQ96DT6 458 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 SPZ1Q9BXG8 430 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PRR12Q9ULL5 1215 aa18.25■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CPLX1O14810 134 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CTDNEP1O95476 244 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CYP2C8P10632 490 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PPP2R5BQ15173 497 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PHKBQ93100 1093 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 LZTS2Q9BRK4 669 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 VAT1LQ9HCJ6 419 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 SLC34A2O95436 690 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 OSBPP22059 807 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 DSG3P32926 999 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 TM4SF4P48230 202 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 INHBEP58166 350 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 COG2Q14746 738 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 RIOX1Q9H6W3 641 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PNMA3Q9UL41 463 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 MYPNQ86TC9 1320 aa18.23■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 JAK2O60674 1132 aa18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PEX10O60683 326 aa18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 IFNAR1P17181 557 aa18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 HERVK_113P62684 666 aa18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 HOMER1Q86YM7 354 aa18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PIGSQ96S52 555 aa18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 PTPDC1A2A3K4 754 aa18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 VWA5AO00534 786 aa18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 MAP2K2P36507 400 aa18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CUL4AQ13619 759 aa18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 MTMR8Q96EF0 704 aa18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 ADGRA2Q96PE1 1338 aa18.21■□□□□ 0.51
CCL25-201ENST00000253451 CDKL5O76039 1030 aa18.2■□□□□ 0.5
CCL25-201ENST00000253451 SMARCA1P28370 1054 aa18.2■□□□□ 0.5
CCL25-201ENST00000253451 QRICH1Q2TAL8 776 aa18.2■□□□□ 0.5
CCL25-201ENST00000253451 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.2■□□□□ 0.5
CCL25-201ENST00000253451 CCDC174Q6PII3 467 aa18.2■□□□□ 0.5
CCL25-201ENST00000253451 REPS2Q8NFH8 660 aa18.2■□□□□ 0.5
CCL25-201ENST00000253451 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CCL25-201ENST00000253451 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CCL25-201ENST00000253451 DDX11Q96FC9 970 aa18.2■□□□□ 0.5
CCL25-201ENST00000253451 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms