RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 MB21D1Q8N884 522 aa24.92■■□□□ 1.58
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HTATSF1-201ENST00000218364 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 MYH8P13535 1937 aa24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS18Q9P253 973 aa24.92■■□□□ 1.58
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HTATSF1-201ENST00000218364 USP17L21D6R901 530 aa24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTN2P35609 894 aa24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS3O15072 1205 aa24.9■■□□□ 1.58
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HTATSF1-201ENST00000218364 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.89■■□□□ 1.58
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HTATSF1-201ENST00000218364 FAM71BQ8TC56 605 aa24.89■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 THAP9Q9H5L6 903 aa24.89■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 DISC1Q9NRI5 854 aa24.89■■□□□ 1.57
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HTATSF1-201ENST00000218364 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
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HTATSF1-201ENST00000218364 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.88■■□□□ 1.57
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HTATSF1-201ENST00000218364 WDR59Q6PJI9 974 aa24.88■■□□□ 1.57
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HTATSF1-201ENST00000218364 MED4Q9NPJ6 270 aa24.87■■□□□ 1.57
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HTATSF1-201ENST00000218364 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 RHOBTB3O94955 611 aa24.85■■□□□ 1.57
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HTATSF1-201ENST00000218364 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.85■■□□□ 1.57
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HTATSF1-201ENST00000218364 MCM3P25205 808 aa24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 DNM2P50570 870 aa24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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HTATSF1-201ENST00000218364 SAR1BQ9Y6B6 198 aa24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 LEKR1Q6ZMV7 388 aa24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 SRGNP10124 158 aa24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 STIM1Q13586 685 aa24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1-201ENST00000218364 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.83■■□□□ 1.57
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