RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000188967.1

Nanog-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Nanog-ps1, Length 250 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Trmt112Q9DCG9 125 aa10.44□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa10.44□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Clip2Q9Z0H8 1047 aa10.44□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Bdp1Q571C7 2467 aa10.44□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tmem265E9Q8G3 109 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 LdhbP16125 334 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Art2aP17981 287 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Alppl2P24823 529 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Traf1P39428 409 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Hps5P59438 1126 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Snap25P60879 206 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tshz1Q5DTH5 1084 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Kctd1Q5M956 257 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cln3Q61124 438 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tekt3Q6X6Z7 490 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mb21d2Q8C525 428 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 DaglbQ91WC9 669 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Bmp2kQ91Z96 1138 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 PdhbQ9D051 359 aa10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Alg13Q9D8C3 1166 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Col5a3Q9JLI2 1739 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Prom1O54990 867 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mdm2P23804 489 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ephb4P54761 987 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ccdc174Q3U155 467 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Myo19Q5SV80 963 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Stxbp3Q60770 592 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Usp50Q6P8X6 390 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ccdc178Q8CDV0 866 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Arhgef6Q8K4I3 771 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rhobtb2Q91V93 728 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mcoln1Q99J21 580 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Lonrf3Q9D4H7 753 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tle2Q9WVB2 767 aa10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Wdr81Q5ND34 1934 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 PfasQ5SUR0 1337 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rbp3P49194 1234 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 BC048507Q80ZS7 89 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Fam109aQ8BH49 266 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 AidaQ8C4Q6 305 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 MyripQ8K3I4 856 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Adam1bQ8R534 806 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Gmcl1Q920G9 524 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Sppl3Q9CUS9 384 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rlbp1Q9Z275 317 aa10.41□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rnf123Q5XPI3 1314 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Fyb2A2A995 729 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cst8P32766 142 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Usp5P56399 858 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Pla2g5P97391 137 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Eepd1Q3TGW2 569 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Q3TYL0 343 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Limch1Q3UH68 1057 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Hand2Q61039 217 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mcph1Q7TT79 822 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Alx1Q8C8B0 326 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Shisa4Q8CA71 197 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Riox2Q8CD15 465 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Mrpl58Q8R035 206 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Erc1Q99MI1 1120 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Pdzd3Q99MJ6 498 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tmem39aQ9CYC3 486 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cep72Q9D3R3 646 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tbx20Q9ES03 445 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cep350E9Q309 3095 aa10.4□□□□□ -0.74
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ulk4Q3V129 1303 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ankrd35E9Q9D8 996 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 SpibO35906 267 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Il13ra2O88786 383 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cd72P21855 354 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Map4k1P70218 827 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Pla2g6P97819 807 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Cep131Q62036 1060 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Trim37Q6PCX9 961 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Fbxo10Q7TQF2 950 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Usp6nlQ80XC3 819 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Vgll2Q8BGW8 322 aa10.39□□□□□ -0.75
Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 Tdp1Q8BJ37 609 aa10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.6 ms