RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004097.15

Cux1-201, Transcript of Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cux1, Length 12,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1-201ENSMUST00000004097 ChmQ9QXG2 665 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Hmg20bQ9Z104 317 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pde6aP27664 859 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Vps37bQ8R0J7 285 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kif24Q6NWW5 1356 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kcna1P16388 495 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Slc16a1P53986 493 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Foxp3Q99JB6 429 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dph5Q9CWQ0 281 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm5935Q497S0 212 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sdr42e1Q9D665 394 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Krt17Q9QWL7 433 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 BhmtO35490 407 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Timm44O35857 452 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cd72P21855 354 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gucy1a3Q9ERL9 691 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Frmpd4A2AFR3 1320 aa9.01□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm5934D3Z4U6 212 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mdm2P23804 489 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Serpina3iD3Z450 408 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ano9P86044 747 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Top1Q04750 767 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gbp5Q8CFB4 590 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Efhd1Q9D4J1 240 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Stx12Q9ER00 274 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rtel1Q0VGM9 1203 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sec23ipQ6NZC7 998 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Alox15P39654 663 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Entpd7Q3TCT4 606 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nudt18Q3U2V3 323 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pnma5Q5DTT8 618 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zbtb12Q9Z150 459 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccdc13D3YV10 709 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm3248K7N721 186 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fndc11Q80WB0 326 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Serpinb13Q8CDC0 389 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Agr3Q8R3W7 165 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Efcab5A0JP43 1406 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Taok1Q5F2E8 1001 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Akap4Q60662 849 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 HomezQ80W88 542 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ing3Q8VEK6 421 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Adarb2Q9JI20 745 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm156Q58A37 223 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sin3bQ62141 1098 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cplx4Q80WM3 160 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Q9DAQ4 598 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm28510A0A087WP28 240 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kpna1Q60960 538 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Klhl20Q8VCK5 604 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mum1l1Q4VA55 681 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tnni1Q9WUZ5 187 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Naip2Q9QUK4 1447 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pcdhga4Q91XY4 930 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Polr3cQ9D483 533 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ubash3aQ3V3E1 624 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 EhhadhQ9DBM2 718 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ubxn2bQ0KL01 331 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ehd2Q8BH64 543 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 ZwilchQ8R060 589 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 MypnQ5DTJ9 1315 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Adcy5P84309 1262 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Myo1gQ5SUA5 1024 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dnajc28Q8VCE1 385 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 AacsQ9D2R0 672 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fmnl1Q9JL26 1094 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccdc175E9PVB3 822 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rgl1Q60695 768 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sv2cQ69ZS6 727 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccdc82Q6PG04 518 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ciapin1Q8WTY4 309 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Spc24Q9D083 201 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rabgef1Q9JM13 491 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccdc153P0C7Q1 202 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tpd52Q62393 224 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mettl7bQ9DD20 244 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Foxred2Q3USW5 665 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dsg3O35902 993 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 GfapP03995 430 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dhx38Q80X98 1228 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kctd6Q8BNL5 237 aa8.99□□□□□ -0.97
Cux1-201ENSMUST00000004097 Smc6Q924W5 1097 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.4 ms