RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639849.1

EPM2A-222, Transcript of EPM2A, laforin glucan phosphatase, human

TSL 3

Gene EPM2A, Length 804 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPM2A-222	ENST00000639849	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	SYNM	O15061	1565 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	ZNF20	P17024	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
EPM2A-222	ENST00000639849	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	PZP	P20742	1482 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	RAD21	O60216	631 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	SLITRK5	O94991	958 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	KCNC1	P48547	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	MED14	O60244	1454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	ITGB3	P05106	788 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	SNX17	Q15036	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	GLMN	Q92990	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	FZD7	O75084	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	CEP152	O94986	1710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	SLURP1	P55000	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	USP51	Q70EK9	711 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	LRIG2	O94898	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	RGS19	P49795	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	KCNB2	Q92953	911 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	POLI	Q9UNA4	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	CEP162	Q5TB80	1403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	FFAR3	O14843	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	CDR1	P51861	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	EHHADH	Q08426	723 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	ALK	Q9UM73	1620 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EPM2A-222	ENST00000639849	CBX7	O95931	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	VIPR1	P32241	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	GALK1	P51570	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	TNK2	Q07912	1038 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	KANK1	Q14678	1352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EPM2A-222	ENST00000639849	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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