RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 NYAP2Q9P242 653 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 TROAPQ12815 778 aa23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 CFAP45Q9UL16 551 aa23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 MTMR7Q9Y216 660 aa23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 CHADLQ6NUI6 762 aa23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.03■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 MOB2Q70IA6 237 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 MKL1Q969V6 931 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN8-208ENST00000635751 DDAH1O94760 285 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 MAP3K9P80192 1104 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 GINM1Q9NU53 330 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CCDC192P0DO97 292 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 LIG1P18858 919 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CDC27P30260 824 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 FANCBQ8NB91 859 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 A0A1W2PRG0 241 aa23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CALM1P0DP23 149 aa23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CALM2P0DP24 149 aa23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CALM3P0DP25 149 aa23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ECE1P42892 770 aa23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ACER1Q8TDN7 264 aa23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 PICK1Q9NRD5 415 aa23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 MYH6P13533 1939 aa23■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 KIF3CO14782 793 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 RCAN1P53805 252 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 MAP3K11Q16584 847 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 RTN1Q16799 776 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 USP17L5A8MUK1 530 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 VGLL4Q14135 290 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 NID2Q14112 1375 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 RAD21O60216 631 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 PTPRAP18433 802 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ATL3Q6DD88 541 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.98■■□□□ 1.27
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CLN8-208ENST00000635751 DACT1Q9NYF0 836 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 TMX2Q9Y320 296 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CSADQ9Y600 493 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CPLX1O14810 134 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 PPFIA3O75145 1194 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 BICD2Q8TD16 824 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 PGBD1Q96JS3 809 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 MAP3K14Q99558 947 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 TNMDQ9H2S6 317 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 USP25Q9UHP3 1055 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 F5H6K3 240 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 PDHBP11177 359 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 YY1P25490 414 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 FOSBP53539 338 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 KLRC3Q07444 240 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 GRM4Q14833 912 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN8-208ENST00000635751 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN8-208ENST00000635751 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CLN8-208ENST00000635751 PPP2R5BQ15173 497 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN8-208ENST00000635751 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CLN8-208ENST00000635751 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN8-208ENST00000635751 KIF5BP33176 963 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN8-208ENST00000635751 NTRK3Q16288 839 aa22.94■■□□□ 1.26
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