RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		6.6	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	BVES	Q8NE79	360 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	GATA6	Q92908	595 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EP300-208	ENST00000635538	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ANKRD62	A6NC57	917 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	SHOX	O15266	292 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	GRB10	Q13322	594 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	TCEA2	Q15560	299 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	RNF43	Q68DV7	783 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	FEZ1	Q99689	392 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ESYT3	A0FGR9	886 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	HMX2	A2RU54	273 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ADCY3	O60266	1144 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	LEFTY1	O75610	366 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	RASSF7	Q02833	373 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	SQSTM1	Q13501	440 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	MFSD4A	Q8N468	514 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	FGD4	Q96M96	766 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538		A0A1W2PQU0	124 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	SIGLEC6	O43699	453 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ITGAV	P06756	1048 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	NFIA	Q12857	509 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	CDC6	Q99741	560 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	AKT3	Q9Y243	479 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	PLAA	Q9Y263	795 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	CBX7	O95931	251 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	FAM153B	P0C7A2	387 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	FGFR1	P11362	822 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ADM	P35318	185 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ZNF445	P59923	1031 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	PPP2R2A	P63151	447 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538		Q96M66	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ATG3	Q9NT62	314 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	GSN	P06396	782 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	FBXL6	Q8N531	539 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	FIBCD1	Q8N539	461 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EP300-208	ENST00000635538	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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