RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CPVLQ9H3G5 476 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF112Q9UJU3 913 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CNPY2Q9Y2B0 182 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TMX2Q9Y320 296 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-215ENST00000628018 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.2
CAPNS1-215ENST00000628018 LMBRD1Q9NUN5 540 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ14Q9UNX9 436 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR90Q96KV7 1748 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SSC5DA1L4H1 1573 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF28PB7ZC32 967 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 BRAPQ7Z569 592 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ACER1Q8TDN7 264 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 GMCL1Q96IK5 515 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 UBA5Q9GZZ9 404 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 GPCPD1Q9NPB8 672 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 KRT85P78386 507 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC96Q2M329 555 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM87AQ8NBN3 555 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PHF20Q9BVI0 1012 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 POTECB2RU33 542 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFB10O96000 172 aa28.74■■■□□ 2.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD1Q719H9 257 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SULF1Q8IWU6 871 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 GDPD2Q9HCC8 539 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DOCK1Q14185 1865 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD21O60216 631 aa28.72■■■□□ 2.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 TTBK2Q6IQ55 1244 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SH2D4AQ9H788 454 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ATL3Q6DD88 541 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-215ENST00000628018 USP48Q86UV5 1035 aa28.71■■■□□ 2.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 BTBD18B2RXH4 712 aa28.7■■■□□ 2.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 FIBPO43427 364 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.69■■■□□ 2.18
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CAPNS1-215ENST00000628018 SCYL3Q8IZE3 742 aa28.69■■■□□ 2.18
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CAPNS1-215ENST00000628018 VCPKMTQ9H867 229 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 JMJD4Q9H9V9 463 aa28.69■■■□□ 2.18
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CAPNS1-215ENST00000628018 NPY5RQ15761 445 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 HOMER1Q86YM7 354 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 MTMR8Q96EF0 704 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
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CAPNS1-215ENST00000628018 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A2P36021 539 aa28.68■■■□□ 2.18
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CAPNS1-215ENST00000628018 NOSTRINQ8IVI9 506 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
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CAPNS1-215ENST00000628018 FZD1Q9UP38 647 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 STXBP3O00186 592 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAK2O60296 914 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT2P35908 639 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 DLK2Q6UY11 383 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 OXER1Q8TDS5 423 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRP5P59047 1200 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 BTNL9Q6UXG8 535 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-215ENST00000628018 USP28Q96RU2 1077 aa28.66■■■□□ 2.18
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