RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB43O43298 467 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFB10O96000 172 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 SLC10A3P09131 477 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 RXRAP19793 462 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CLCN6P51797 869 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 KLRC3Q07444 240 aa9.95□□□□□ -0.82
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SGMS1-211ENST00000626236 CALM1P0DP23 149 aa9.94□□□□□ -0.82
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SGMS1-211ENST00000626236 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 GTF2A2P52657 109 aa9.94□□□□□ -0.82
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SGMS1-211ENST00000626236 HTRA3P83110 453 aa9.94□□□□□ -0.82
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SGMS1-211ENST00000626236 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 MYH6P13533 1939 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.93□□□□□ -0.82
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SGMS1-211ENST00000626236 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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SGMS1-211ENST00000626236 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD1Q719H9 257 aa9.93□□□□□ -0.82
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SGMS1-211ENST00000626236 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 LPAR1Q92633 364 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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SGMS1-211ENST00000626236 C12orf42Q96LP6 360 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 NID2Q14112 1375 aa9.92□□□□□ -0.82
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SGMS1-211ENST00000626236 HSPA6P17066 643 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 KIF5BP33176 963 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 RCAN1P53805 252 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 RTN1Q16799 776 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 TREML2Q5T2D2 321 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 HSCBQ8IWL3 235 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 NECAB1Q8N987 351 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 FANCBQ8NB91 859 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 CAPNS2Q96L46 248 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-211ENST00000626236 MAP3K14Q99558 947 aa9.92□□□□□ -0.82
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