RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
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C9orf170-201ENST00000623052 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.13■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 KIF20AO95235 890 aa15.13■□□□□ 0.01
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C9orf170-201ENST00000623052 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 NELFBQ8WX92 580 aa15.11■□□□□ 0.01
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C9orf170-201ENST00000623052 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TFAP4Q01664 338 aa15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 PAK1Q13153 545 aa15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 TEX35Q5T0J7 233 aa15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 PPFIBP1Q86W92 1011 aa15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 VPS16Q9H269 839 aa15.1■□□□□ 0.01
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD10Q9NUJ1 306 aa15.1■□□□□ 0.01
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C9orf170-201ENST00000623052 PNMA1Q8ND90 353 aa15.1■□□□□ 0.01
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