RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-221	ENST00000619151	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		32.09	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		32.09	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		32.09	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	SNHG28	P0DPA3	235 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	ATP2B2	Q01814	1243 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	ICA1	Q05084	483 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	MKL1	Q969V6	931 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	MYH4	Q9Y623	1939 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRF1-221	ENST00000619151	SLURP2	P0DP57	97 aa		32.07	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		32.07	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	USP28	Q96RU2	1077 aa		32.07	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		32.07	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		32.07	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		32.07	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	USP17L5	A8MUK1	530 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	GDF11	O95390	407 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	KRT2	P35908	639 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	SEPT2	Q15019	361 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	SULF1	Q8IWU6	871 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	KIF3C	O14782	793 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	TEPSIN	Q96N21	525 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	YEATS4	O95619	227 aa		32.04	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	GH2	P01242	217 aa		32.04	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		32.04	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		32.04	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	BTBD18	B2RXH4	712 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	CALML3	P27482	149 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	DCAF4	Q8WV16	495 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF543	Q08ER8	600 aa		32.02	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		32.02	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	CYTH3	O43739	400 aa		32.01	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	NLRP5	P59047	1200 aa		32.01	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	MAP3K10	Q02779	954 aa		32.01	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	STK38	Q15208	465 aa		32.01	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		32.01	■■■□□ 2.72
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC96	Q2M329	555 aa		32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	ANO1	Q5XXA6	986 aa		32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		32	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	ADM5	C9JUS6	153 aa		31.99	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	GALNT17	Q6IS24	598 aa		31.99	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	CHADL	Q6NUI6	762 aa		31.99	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	HOOK2	Q96ED9	719 aa		31.99	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	31.99	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		31.99	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		31.98	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	SLFN13	Q68D06	897 aa		31.98	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		31.98	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		31.98	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	BARHL2	Q9NY43	387 aa		31.98	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		31.97	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	SHISA4	Q96DD7	197 aa		31.97	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		31.97	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	CLIC4	Q9Y696	253 aa		31.97	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	SLC1A4	P43007	532 aa		31.96	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		31.96	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	JMY	Q8N9B5	988 aa		31.96	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	BICD2	Q8TD16	824 aa		31.96	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	GINM1	Q9NU53	330 aa		31.96	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	CAP2	P40123	477 aa		31.95	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	NR5A1	Q13285	461 aa		31.95	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		31.95	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		31.95	■■■□□ 2.71
BRF1-221	ENST00000619151	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		31.95	■■■□□ 2.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms