RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 NDUFB10O96000 172 aa20.38■□□□□ 0.85
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HERC3-214ENST00000601319 CCL5P13501 91 aa20.38■□□□□ 0.85
HERC3-214ENST00000601319 KLRC3Q07444 240 aa20.38■□□□□ 0.85
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HERC3-214ENST00000601319 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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HERC3-214ENST00000601319 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.38■□□□□ 0.85
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HERC3-214ENST00000601319 NT5C2P49902 561 aa20.36■□□□□ 0.85
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HERC3-214ENST00000601319 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.35■□□□□ 0.85
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HERC3-214ENST00000601319 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.34■□□□□ 0.85
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HERC3-214ENST00000601319 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
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HERC3-214ENST00000601319 SLC25A27O95847 323 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 ERCC3P19447 782 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.32■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 IL25Q9H293 177 aa20.32■□□□□ 0.84
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HERC3-214ENST00000601319 ZNF213O14771 459 aa20.31■□□□□ 0.84
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HERC3-214ENST00000601319 BMP3P12645 472 aa20.31■□□□□ 0.84
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HERC3-214ENST00000601319 PLS1Q14651 629 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 SLFN13Q68D06 897 aa20.31■□□□□ 0.84
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HERC3-214ENST00000601319 IGHA2P01877 340 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 FDX1P10109 184 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 ADORA2AP29274 412 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 STAT3P40763 770 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 TRIM32Q13049 653 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HERC3-214ENST00000601319 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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