RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593438.1

HOXA-AS2-211, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXA-AS2, Length 629 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FAM110CQ1W6H9 321 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCDC96Q2M329 555 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KCTD1Q719H9 257 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NEK1Q96PY6 1258 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RBPJLQ9UBG7 517 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TMEM232C9JQI7 657 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DSG3P32926 999 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HSPA4P34932 840 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KRT32Q14532 448 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ARHGEF6Q15052 776 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TMEM67Q5HYA8 995 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PNMA1Q8ND90 353 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ANKS1AQ92625 1134 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ATG4CQ96DT6 458 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GMCL1Q96IK5 515 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLF1Q9BQI6 1058 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 USP26Q9BXU7 913 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PRC1O43663 620 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PSMC4P43686 418 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ANTXR2P58335 489 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PLS1Q14651 629 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DCAF4Q8WV16 495 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIFC2Q96AC6 838 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 EFCC1Q9HA90 598 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MORF4L1Q9UBU8 362 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FEM1BQ9UK73 627 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TRIM17Q9Y577 477 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MYPNQ86TC9 1320 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FCGRTP55899 365 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ERVK-9P63128 1117 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ERVK-24P63145 666 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 WTAPQ15007 396 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SEC23AQ15436 765 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADCK5Q3MIX3 580 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TSGA10IPQ3SY00 556 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LBX2Q6XYB7 198 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CHURC1Q8WUH1 139 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GPCPD1Q9NPB8 672 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 BTBD7Q9P203 1132 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SNX14Q9Y5W7 946 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PDHBP11177 359 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 STAT2P52630 851 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 Q3C1V9 767 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MB21D1Q8N884 522 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TRIM47Q96LD4 638 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LRRC2Q9BYS8 371 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 VWA5AO00534 786 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZBED4O75132 1171 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CNMDO75829 334 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CTGFP29279 349 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCNA1P78396 465 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CAP1Q01518 475 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 WDR78Q5VTH9 848 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NFXL1Q6ZNB6 911 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FAM160B2Q86V87 743 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KCNB2Q92953 911 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TMEM87BQ96K49 555 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SENP2Q9HC62 589 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SEC24BO95487 1268 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 GOLGA8HP0CJ92 632 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PSMA5P28066 241 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 HOXD10P28358 340 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLC16A2P36021 539 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLC4A3P48751 1232 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FGD1P98174 961 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF543Q08ER8 600 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TTBK2Q6IQ55 1244 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CATIPQ7Z7H3 387 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 COA7Q96BR5 231 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TCEANC2Q96MN5 208 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RLFQ13129 1914 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCDC69A6NI79 296 aa17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms