RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 RAD50Q92878 1312 aa23.57■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 NMT2O60551 498 aa23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 UBXN2AP68543 259 aa23.55■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.55■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 INHAP05111 366 aa23.54■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.54■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.54■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 VWA5AO00534 786 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF213O14771 459 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 CCL5P13501 91 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 CYP2B6P20813 491 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 PTPREP23469 700 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 REPS2Q8NFH8 660 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 TOMM22Q9NS69 142 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 MAP2K5Q13163 448 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 GRB14Q14449 540 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 SLFN13Q68D06 897 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 SKAP1Q86WV1 359 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 TRIB2Q92519 343 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 STX8Q9UNK0 236 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 NEDD4P46934 1319 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-217ENST00000590124 HMGCRP04035 888 aa23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 ERCC3P19447 782 aa23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 RGS2P41220 211 aa23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 WDR78Q5VTH9 848 aa23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 GMCL1Q96IK5 515 aa23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 APBA2Q99767 749 aa23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 BRCA2P51587 3418 aa23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 GJB1P08034 283 aa23.5■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 BMP3P12645 472 aa23.5■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 PLS1Q14651 629 aa23.5■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF208Q9H0X6 261 aa23.5■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 MROH8Q9H579 483 aa23.5■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 FEM1BQ9UK73 627 aa23.5■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 SGSM2O43147 1006 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 STRNO43815 780 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 HOXC6P09630 235 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 NT5C2P49902 561 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 TRIM32Q13049 653 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 SHISA4Q96DD7 197 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC25A27O95847 323 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 GJA8P48165 433 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 PTH1RQ03431 593 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 CCL14Q16627 93 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 ESR2Q92731 530 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 MCCP23508 829 aa23.47■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 STAT3P40763 770 aa23.47■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC1A4P43007 532 aa23.47■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.47■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.47■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.47■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM232C9JQI7 657 aa23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP2A1O14983 1001 aa23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 IGHA2P01877 340 aa23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-217ENST00000590124 KIFC2Q96AC6 838 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms