RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590104.1

LAMA3-211, Transcript of laminin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMA3, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3-211ENST00000590104 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.13□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 KIF16BQ96L93 1317 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 CCER2I3L3R5 266 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 F11P03951 625 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 GJB1P08034 283 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 CCL5P13501 91 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 SLFN5Q08AF3 891 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 NR1H3Q13133 447 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 MAP3K11Q16584 847 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 RNF208Q9H0X6 261 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 TAF5LO75529 589 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 FOSL2P15408 326 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 TNNI2P48788 182 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 FZD1Q9UP38 647 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 CACNA1FO60840 1977 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 MAST3O60307 1309 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 PLIN1O60240 522 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 TRAK2O60296 914 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 PDE8BO95263 885 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 USP38Q8NB14 1042 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 USP44Q9H0E7 712 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 SCN9AQ15858 1988 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 OIP5O43482 229 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 MAP2K3P46734 347 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 CFAP100Q494V2 611 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 METTL24Q5JXM2 366 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 LPIN2Q92539 896 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 SUCLG2Q96I99 432 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 GPAMQ9HCL2 828 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
LAMA3-211ENST00000590104 CIAO1O76071 339 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 GNRH1P01148 92 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 GNAI3P08754 354 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 CERS5Q8N5B7 392 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 TEKT1Q969V4 418 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 KAZALD1Q96I82 304 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 PTPN18Q99952 460 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 MXD3Q9BW11 206 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 PSME4Q14997 1843 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 EYA2O00167 538 aa8.07□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 IGSF3O75054 1194 aa8.07□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 SGPL1O95470 568 aa8.07□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 ITGB2P05107 769 aa8.07□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
LAMA3-211ENST00000590104 SLC5A1P13866 664 aa8.07□□□□□ -1.12
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