RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589706.1

SMAD4-208, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-208	ENST00000589706	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	GFRA2	O00451	464 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	SELP	P16109	830 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	POU4F3	Q15319	338 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC15A2	Q16348	729 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	CORO1B	Q9BR76	489 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	KRT82	Q9NSB4	513 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	STK32B	Q9NY57	414 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	ATP10D	Q9P241	1426 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	GJB6	O95452	261 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	ECEL1	O95672	775 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	PTPRO	Q16827	1216 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	GPATCH3	Q96I76	525 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	TM9SF2	Q99805	663 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	STK26	Q9P289	416 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	TECPR2	O15040	1411 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A1W2PQH9	124 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	FSCN2	O14926	492 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	CDC45	O75419	566 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	DDAH1	O94760	285 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	HTR3B	O95264	441 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	GUCY2C	P25092	1073 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	MAOB	P27338	520 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	INPP5A	Q14642	412 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	HDX	Q7Z353	690 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	APPBP2	Q92624	585 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	FANCL	Q9NW38	375 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SMAD4-208	ENST00000589706	ALB	P02768	609 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	EVA1C	P58658	441 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	CHRNA2	Q15822	529 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	MTERF2	Q49AM1	385 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	TTC6	Q86TZ1	520 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	MAP7D2	Q96T17	732 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	NUP155	O75694	1391 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	ESYT3	A0FGR9	886 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF862	O60290	1169 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	LILRB5	O75023	590 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	CTSB	P07858	339 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	TPM2	P07951	284 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	PDE3A	Q14432	1141 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	TXNRD1	Q16881	649 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	HOMER1	Q86YM7	354 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	EPX	P11678	715 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	LIG1	P18858	919 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	PLCG1	P19174	1290 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	IGBP1	P78318	339 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SMAD4-208	ENST00000589706	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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