RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589419.1

CCBE1-204, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

TSL 4

Gene CCBE1, Length 587 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCBE1-204ENST00000589419 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.95■□□□□ 0.14
CCBE1-204ENST00000589419 ESYT2A0FGR8 921 aa15.95■□□□□ 0.14
CCBE1-204ENST00000589419 C19orf81C9J6K1 198 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCBE1-204ENST00000589419 KRT2P35908 639 aa15.95■□□□□ 0.14
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