RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589266.5

CIRBP-223, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 3

Gene CIRBP, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-223	ENST00000589266	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266		Q6ZUG5	572 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	CHST3	Q7LGC8	479 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	INPP5B	P32019	993 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	GUCY1A2	P33402	732 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	FGD1	P98174	961 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	WTAP	Q15007	396 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	CEP95	Q96GE4	821 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	PRO3102	Q9H379	93 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	NYAP2	Q9P242	653 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	TTLL1	O95922	423 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	EVC	P57679	992 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	JAG1	P78504	1218 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	SEPT2	Q15019	361 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	MKL1	Q969V6	931 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	LY9	Q9HBG7	655 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	PICK1	Q9NRD5	415 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	DLL1	O00548	723 aa		29.34	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	NMT2	O60551	498 aa		29.34	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	ICA1	Q05084	483 aa		29.34	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	SNX21	Q969T3	373 aa		29.34	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		29.34	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	AK2	P54819	239 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	STX8	Q9UNK0	236 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L5	A8MUK1	530 aa		29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	RCAN1	P53805	252 aa		29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	FCGRT	P55899	365 aa		29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	PRKCZ	Q05513	592 aa		29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	BRF1	Q92994	677 aa		29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		29.32	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	PTPRA	P18433	802 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	WDR18	Q9BV38	432 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	SH2D4A	Q9H788	454 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	CCDC69	A6NI79	296 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	MOGS	Q13724	837 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	KAT14	Q9H8E8	782 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266		A0A1W2PPC1	479 aa		29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	SGPL1	O95470	568 aa		29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	BCR	P11274	1271 aa		29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266		A0A0C4DFX4	3053 aa		29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		29.29	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	TMX2	Q9Y320	296 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	MYH4	Q9Y623	1939 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	MGAM	O43451	1857 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	CXCL11	O14625	94 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	DDAH1	O94760	285 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	MAP3K14	Q99558	947 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CIRBP-223	ENST00000589266	EVI5	O60447	810 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	CALM1	P0DP23	149 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	CALM2	P0DP24	149 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	CALM3	P0DP25	149 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	CYP2C8	P10632	490 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	CAPN2	P17655	700 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	PNMA1	Q8ND90	353 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	SENP2	Q9HC62	589 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	GABRQ	Q9UN88	632 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	APOBR	Q0VD83	1088 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	PPP2R5B	Q15173	497 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	APOA5	Q6Q788	366 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		29.25	■■■□□ 2.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms