RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 KLRC3Q07444 240 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 SLFN13Q68D06 897 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 ACER1Q8TDN7 264 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 VPS54Q9P1Q0 977 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF112Q9UJU3 913 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 TMX2Q9Y320 296 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR90Q96KV7 1748 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 ECE1P42892 770 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 PIBF1Q8WXW3 757 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF341Q9BYN7 854 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 UBA5Q9GZZ9 404 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 GDPD2Q9HCC8 539 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 GINM1Q9NU53 330 aa30.08■■■□□ 2.41
SCAMP4-210ENST00000588555 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP30.07■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM87AQ8NBN3 555 aa30.07■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 GMCL1Q96IK5 515 aa30.07■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 PHF20Q9BVI0 1012 aa30.07■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 GPCPD1Q9NPB8 672 aa30.07■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 POTECB2RU33 542 aa30.06■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 NDUFB10O96000 172 aa30.06■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 XBP1P17861 261 aa30.06■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 PTMSP20962 102 aa30.06■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 BRAPQ7Z569 592 aa30.06■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 DOCK1Q14185 1865 aa30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT85P78386 507 aa30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC96Q2M329 555 aa30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 KCTD1Q719H9 257 aa30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 NCLP19338 710 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 INPP5BP32019 993 aa30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC1A4P43007 532 aa30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 TTBK2Q6IQ55 1244 aa30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 NPY5RQ15761 445 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 USP48Q86UV5 1035 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 SULF1Q8IWU6 871 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 ADM5C9JUS6 153 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 FIBPO43427 364 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 PIGSQ96S52 555 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.03■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 BTBD18B2RXH4 712 aa30.02■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 RAD21O60216 631 aa30.02■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa30.02■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 WWC2Q6AWC2 1192 aa30.02■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 DLK2Q6UY11 383 aa30.02■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 FZD1Q9UP38 647 aa30.02■■■□□ 2.4
SCAMP4-210ENST00000588555 MYSM1Q5VVJ2 828 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 ATL3Q6DD88 541 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 TYW1BQ6NUM6 668 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRF4Q8IZF3 695 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 KLRG1Q96E93 195 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 WRNIP1Q96S55 665 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 SH2D4AQ9H788 454 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 JMJD4Q9H9V9 463 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 VAT1LQ9HCJ6 419 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 BARHL2Q9NY43 387 aa30.01■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT26Q7Z3Y9 468 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 HOMER1Q86YM7 354 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 OXER1Q8TDS5 423 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 MTMR8Q96EF0 704 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 VCPKMTQ9H867 229 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 GOPCQ9HD26 462 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 STXBP3O00186 592 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC16A2P36021 539 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 SCYL3Q8IZE3 742 aa30■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAK2O60296 914 aa29.99■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 BMP3P12645 472 aa29.99■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 NR5A1Q13285 461 aa29.99■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 USP28Q96RU2 1077 aa29.99■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.98■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa29.98■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.98■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29.98■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 CFAP45Q9UL16 551 aa29.98■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 ELP1O95163 1332 aa29.97■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT2P35908 639 aa29.97■■■□□ 2.39
SCAMP4-210ENST00000588555 BTNL9Q6UXG8 535 aa29.97■■■□□ 2.39
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