RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587379.1

USP36-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 3

Gene USP36, Length 606 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-208	ENST00000587379	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	TRIB2	Q92519	343 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	APPBP2	Q92624	585 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	GUCD1	Q96NT3	240 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	PRDM1	O75626	825 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	TDO2	P48775	406 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	RABEP1	Q15276	862 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54	5e-8	■■□□□ 14.4
USP36-208	ENST00000587379	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	SGPL1	O95470	568 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	HMGCR	P04035	888 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	MCC	P23508	829 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	ANAPC15	P60006	121 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	PLS1	Q14651	629 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	HSCB	Q8IWL3	235 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379		A0A0G2JMZ2	1700 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	TTC28	Q96AY4	2481 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP36-208	ENST00000587379	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	RLF	Q13129	1914 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	FLOT1	O75955	427 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	MAPK4	P31152	587 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	PARP14	Q460N5	1801 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	RAD50	Q92878	1312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	RASA1	P20936	1047 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	MORN1	Q5T089	497 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	SNX27	Q96L92	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	IL25	Q9H293	177 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	TMX2	Q9Y320	296 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	ALPK3	Q96L96	1907 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	HSPA4	P34932	840 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	RGS2	P41220	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	CCNA1	P78396	465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	COG2	Q14746	738 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	USP6NL	Q92738	828 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	FAM161B	Q96MY7	647 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	APBA2	Q99767	749 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP36-208	ENST00000587379	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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