RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 PTPN18Q99952 460 aa14.72□□□□□ -0.05
DNMT1-208ENST00000586667 PCNTO95613 3336 aa14.72□□□□□ -0.05
DNMT1-208ENST00000586667 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
DNMT1-208ENST00000586667 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.71□□□□□ -0.05
DNMT1-208ENST00000586667 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
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DNMT1-208ENST00000586667 FUT2Q10981 343 aa14.71□□□□□ -0.05
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DNMT1-208ENST00000586667 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.71□□□□□ -0.05
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DNMT1-208ENST00000586667 SNX21Q969T3 373 aa14.71□□□□□ -0.05
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DNMT1-208ENST00000586667 BTBD19C9JJ37 291 aa14.7□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
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DNMT1-208ENST00000586667 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.7□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.7□□□□□ -0.06
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DNMT1-208ENST00000586667 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.7□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.7□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 GTF3C6Q969F1 213 aa14.7□□□□□ -0.06
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DNMT1-208ENST00000586667 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.7□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.69□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.69□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CYTH3O43739 400 aa14.69□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 VEGFBP49765 207 aa14.69□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
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DNMT1-208ENST00000586667 TMX3Q96JJ7 454 aa14.69□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.69□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
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DNMT1-208ENST00000586667 RAD21O60216 631 aa14.68□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CTDNEP1O95476 244 aa14.68□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CALM1P0DP23 149 aa14.68□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CALM2P0DP24 149 aa14.68□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CALM3P0DP25 149 aa14.68□□□□□ -0.06
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DNMT1-208ENST00000586667 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.68□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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DNMT1-208ENST00000586667 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM232C9JQI7 657 aa14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 PLA2G6O60733 806 aa14.67□□□□□ -0.06
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DNMT1-208ENST00000586667 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 SLC16A2P36021 539 aa14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 MCM2P49736 904 aa14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 GRM1Q13255 1194 aa14.67□□□□□ -0.06
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DNMT1-208ENST00000586667 REPS2Q8NFH8 660 aa14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 USP17L15C9J2P7 530 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 USP17L11C9JVI0 530 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 KLRF2D3W0D1 207 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 USP17L18D6R9N7 530 aa14.66□□□□□ -0.06
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