RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586541.5

PRKAR1A-212, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PRKAR1A, Length 570 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-212ENST00000586541 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 DLL1O00548 723 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 PLIN1O60240 522 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADAM11O75078 769 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 BMP6P22004 513 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 NME2P22392 152 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 COL8A1P27658 744 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 NGEFQ8N5V2 710 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 IP6K1Q92551 441 aa7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PRKAR1A-212ENST00000586541 ECEL1O95672 775 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 CYP11A1P05108 521 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 MAOBP27338 520 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 ARNTP27540 789 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 LIG3P49916 1009 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLFN5Q08AF3 891 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 AP3B2Q13367 1082 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 POU4F3Q15319 338 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 GRIK4Q16099 956 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 RASIP1Q5U651 963 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 RELL1Q8IUW5 271 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 USP26Q9BXU7 913 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 CBX8Q9HC52 389 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 USP35Q9P2H5 1018 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 SAMM50Q9Y512 469 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.08□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 C4BP0C0L5 1744 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 MEGF6O75095 1541 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 EXOC5O00471 708 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 RLBP1P12271 317 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 IL2RBP14784 551 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 ELNP15502 786 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC15A2Q16348 729 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 TXNRD1Q16881 649 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.07□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 CTSBP07858 339 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF394Q53GI3 561 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 PDZD3Q86UT5 571 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 CORO1BQ9BR76 489 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 MTFR1LQ9H019 292 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.06□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 APAF1O14727 1248 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 WISP1O95388 367 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 DLGAP3O95886 979 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 PWP1Q13610 501 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 LRRC14Q15048 493 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 USP48Q86UV5 1035 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 NME9Q86XW9 330 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 PHC3Q8NDX5 983 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 KCNB2Q92953 911 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 TMEM74Q96NL1 305 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 STK17AQ9UEE5 414 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 C4AP0C0L4 1744 aa7.04□□□□□ -1.28
PRKAR1A-212ENST00000586541 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.6 ms