RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 FBXO3Q9UK99 471 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 APBB1O00213 710 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 ANXA1P04083 346 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 SLC5A1P13866 664 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 CSF2RAP15509 400 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 FAAP100Q0VG06 881 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 GRB10Q13322 594 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 TREML2Q5T2D2 321 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 PI4K2BQ8TCG2 481 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 TMX3Q96JJ7 454 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-218ENST00000584243 NBEAQ8NFP9 2946 aa9.53□□□□□ -0.88
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GGA3-218ENST00000584243 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 VPS53Q5VIR6 699 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 MFSD5Q6N075 450 aa9.52□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.52□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 KIF3AQ9Y496 699 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 COPS6Q7L5N1 327 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 CD209Q9NNX6 404 aa9.51□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 COPRSQ9NQ92 184 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 JAG2Q9Y219 1238 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 IGHA2P01877 340 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 CA3P07451 260 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.897e-7■■■■□ 20.8
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GGA3-218ENST00000584243 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 PTPN13Q12923 2485 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 ITPR1Q14643 2758 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 KBTBD13C9JR72 458 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 ANO1Q5XXA6 986 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 RNF135Q8IUD6 432 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 RGS22Q8NE09 1264 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-218ENST00000584243 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 CLCN1P35523 988 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 MCTP1Q6DN14 999 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-218ENST00000584243 AACSQ86V21 672 aa9.48□□□□□ -0.89
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