RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		29.26	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		29.26	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0G2JMZ2	1700 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	SEC24B	O95487	1268 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	BMP3	P12645	472 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	NOV	P48745	357 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	PNMA1	Q8ND90	353 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	FKTN	O75072	461 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	COG2	Q14746	738 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	SP3	Q02447	781 aa		29.23	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	KCTD1	Q719H9	257 aa		29.23	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	SEC23A	Q15436	765 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	C17orf99	Q6UX52	265 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	DCAF4	Q8WV16	495 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	KCNB2	Q92953	911 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	GMCL1	Q96IK5	515 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM232	C9JQI7	657 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	FGD1	P98174	961 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	KIFC2	Q96AC6	838 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM87B	Q96K49	555 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	MYH6	P13533	1939 aa		29.2	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	PEX10	O60683	326 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	CPA1	P15085	419 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	PSMA5	P28066	241 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	DSG3	P32926	999 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	KIF22	Q14807	665 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	ANKS1A	Q92625	1134 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	ATG4C	Q96DT6	458 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	FEM1B	Q9UK73	627 aa		29.2	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	PDHB	P11177	359 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	BCR	P11274	1271 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	STAT2	P52630	851 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	ERO1A	Q96HE7	468 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	SENP2	Q9HC62	589 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC69	A6NI79	296 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	PLS1	Q14651	629 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	LY9	Q9HBG7	655 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	MYPN	Q86TC9	1320 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	ERVK-9	P63128	1117 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	ERVK-24	P63145	666 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	FAM160B2	Q86V87	743 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	MTA3	Q9BTC8	594 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	PLXNB2	O15031	1838 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	RPS6KB1	P23443	525 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF543	Q08ER8	600 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	WDR78	Q5VTH9	848 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	LBX2	Q6XYB7	198 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	MB21D1	Q8N884	522 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	BTBD7	Q9P203	1132 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
GPS1-223	ENST00000584229	ZBED4	O75132	1171 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	SLC16A2	P36021	539 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	SLC4A3	P48751	1232 aa		29.13	■■■□□ 2.25

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