RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-217	ENST00000583667	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	NEDD4	P46934	1319 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	ESR2	Q92731	530 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	MGAM	O43451	1857 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667		B4E1Z4	1266 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	PDC	P20941	246 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-217	ENST00000583667	NID2	Q14112	1375 aa		13.96	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	KDM4A	O75164	1064 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	COL6A1	P12109	1028 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	USP5	P45974	858 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	PDE4B	Q07343	736 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	SCRN1	Q12765	414 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	SNX27	Q96L92	541 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	PTMS	P20962	102 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	SYT1	P21579	422 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	GJB2	P29033	226 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	INPP5B	P32019	993 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	MCM4	P33991	863 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	TRIM32	Q13049	653 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	HMGCR	P04035	888 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	CRK	P46108	304 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	CACNB3	P54284	484 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	SEC23A	Q15436	765 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	SHH	Q15465	462 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	COA7	Q96BR5	231 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	FLT1	P17948	1338 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	ERICH2	A1L162	156 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	STX6	O43752	255 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	PKP1	Q13835	747 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-217	ENST00000583667	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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