RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 TNK2Q07912 1038 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF124Q15973 351 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CRELD1Q96HD1 420 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 MBD5Q9P267 1494 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PREX2Q70Z35 1606 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 MESP2Q0VG99 397 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 MLANAQ16655 118 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PHC3Q8NDX5 983 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ABCC2Q92887 1545 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 RAC2P15153 192 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 LMNB2Q03252 620 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 RALBP1Q15311 655 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 FYB2Q5VWT5 728 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 MRS2Q9HD23 443 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PLCH2O75038 1416 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 USP47Q96K76 1375 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CHD1O14646 1710 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 SORBS3O60504 671 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CILPO75339 1184 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CTSHP09668 335 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ERCC3P19447 782 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PWP1Q13610 501 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 FAM13CQ8NE31 585 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ERBINQ96RT1 1412 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ATP10AO60312 1499 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PLCG1P19174 1290 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 Q96M66 194 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PLXNC1O60486 1568 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 FAM221AA4D161 298 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 TSPAN15O95858 294 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 ESR1P03372 595 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 RAP1GAPP47736 663 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 TTC6Q86TZ1 520 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 RELL1Q8IUW5 271 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 RNF141Q8WVD5 230 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 RHOVQ96L33 236 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 FAM161BQ96MY7 647 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM74Q96NL1 305 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-215ENST00000583289 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-215ENST00000583289 UNC13BO14795 1591 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-215ENST00000583289 F13A1P00488 732 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-215ENST00000583289 PF4P02776 101 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-215ENST00000583289 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-215ENST00000583289 GAB4Q2WGN9 574 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-215ENST00000583289 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-215ENST00000583289 CREG2Q8IUH2 290 aa6.02□□□□□ -1.45
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