RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 SH2D4AQ9H788 454 aa27.09■■□□□ 1.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 GJB4Q9NTQ9 266 aa27.09■■□□□ 1.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.09■■□□□ 1.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 NDUFB10O96000 172 aa27.08■■□□□ 1.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 POTEIP0CG38 1075 aa27.08■■□□□ 1.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 POTEJP0CG39 1038 aa27.08■■□□□ 1.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
RARA-AS1-201ENST00000581080 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 GUCY1B3Q02153 619 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 CPVLQ9H3G5 476 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOPCQ9HD26 462 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYH6P13533 1939 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRKG1Q13976 671 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC96Q2M329 555 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCTD1Q719H9 257 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPCPD1Q9NPB8 672 aa27.07■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 DOCK1Q14185 1865 aa27.06■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 NF2P35240 595 aa27.06■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM29Q14134 588 aa27.06■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 PICK1Q9NRD5 415 aa27.06■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 KRT40Q6A162 431 aa27.05■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 FERMT3Q86UX7 667 aa27.05■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 VCPKMTQ9H867 229 aa27.05■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.05■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 SCG2P13521 617 aa27.04■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPRAP18433 802 aa27.04■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.04■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.04■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 GBP4Q96PP9 640 aa27.04■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAP3K9P80192 1104 aa27.04■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPICE1Q8N0Z3 855 aa27.04■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 BMP3P12645 472 aa27.03■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 XBP1P17861 261 aa27.03■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa27.03■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR18Q9BV38 432 aa27.03■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa27.03■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 FEZ1Q99689 392 aa27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 IREB2P48200 963 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 MCTP1Q6DN14 999 aa27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 LDHDQ86WU2 507 aa27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC16A2P36021 539 aa27.01■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 RESTQ13127 1097 aa27.01■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 NFKBIBQ15653 356 aa27.01■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.01■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.01■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L10C9JJH3 530 aa27■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 MMP1P03956 469 aa27■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 VGLL4Q14135 290 aa27■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF280CQ8ND82 737 aa27■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 SHISA4Q96DD7 197 aa27■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIGSQ96S52 555 aa27■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 JMJD4Q9H9V9 463 aa27■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZHX2Q9Y6X8 837 aa27■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPP2Q13103 211 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAP3K11Q16584 847 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 HOMER1Q86YM7 354 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 LPAR1Q92633 364 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 CSADQ9Y600 493 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.99■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM232C9JQI7 657 aa26.98■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.98■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTMR8Q96EF0 704 aa26.98■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.97■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP14P54578 494 aa26.97■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 BACE1P56817 501 aa26.97■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTMR2Q13614 643 aa26.97■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.97■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 BARHL2Q9NY43 387 aa26.97■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRAF5O00463 557 aa26.97■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 MCM4P33991 863 aa26.97■■□□□ 1.91
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms