RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM83A	Q86UY5	434 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MKL1	Q969V6	931 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TNMD	Q9H2S6	317 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CABP5	Q9NP86	173 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLURP2	P0DP57	97 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAP3K11	Q16584	847 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GALNT17	Q6IS24	598 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TNFRSF25	Q93038	417 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SPON1	Q9HCB6	807 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		33.45	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		33.45	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		33.45	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		33.45	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CNTNAP1	P78357	1384 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RASSF7	Q02833	373 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VEZT	Q9HBM0	779 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BARHL2	Q9NY43	387 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RBSN	Q9H1K0	784 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FZD9	O00144	591 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CMA1	P23946	247 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ATP2B2	Q01814	1243 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF543	Q08ER8	600 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	WNT10B	O00744	389 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CTAGE5	O15320	804 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BLID	Q8IZY5	108 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CUTA	O60888	179 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DPF2	Q92785	391 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STXBP3	O00186	592 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ICA1	Q05084	483 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CAMK4	Q16566	473 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BMP15	O95972	392 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRAPPC10	P48553	1259 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SEPT2	Q15019	361 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRIM75P	A6NK02	468 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TBC1D12	O60347	775 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TNNI2	P48788	182 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CPVL	Q9H3G5	476 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GDF11	O95390	407 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DCAF4	Q8WV16	495 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600		A0A1B0GVL5	298 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCDC192	P0DO97	292 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PIGS	Q96S52	555 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PRELP	P51888	382 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HOMER1	Q86YM7	354 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCDC96	Q2M329	555 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM205C	A6NFA0	338 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GH2	P01242	217 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NDUFA8	P51970	172 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NAPA	P54920	295 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ATP2B1	P20020	1258 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PTPRE	P23469	700 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GNA11	P29992	359 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TNFAIP1	Q13829	316 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CTDNEP1-208	ENST00000573600		M0R2N6	131 aa		33.33	■■■□□ 2.93

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