RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 BLIDQ8IZY5 108 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 BARHL2Q9NY43 387 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 STXBP3O00186 592 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 BMP15O95972 392 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 SNHG28P0DPA3 235 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 GALNT17Q6IS24 598 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 TRAPPC10P48553 1259 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 NIM1KQ8IY84 436 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 SLURP2P0DP57 97 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 STX1AQ16623 288 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 TTC38Q5R3I4 469 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 CPVLQ9H3G5 476 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 ADAMTS3O15072 1205 aa23.45■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.45■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.45■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 CBX8Q9HC52 389 aa23.45■■□□□ 1.35
CTU2-210ENST00000567949 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.45■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 M0R2N6 131 aa23.45■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 SPDYE6P0CI01 402 aa23.45■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.45■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 USP25Q9UHP3 1055 aa23.45■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.45■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 GRIN1Q05586 938 aa23.44■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.44■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.44■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 FAM196BA6NMK8 535 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 WNT7AO00755 349 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 OGFOD1Q8N543 542 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ZNF165P49910 485 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 DLGAP5Q15398 846 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ZNF174Q15697 407 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ANO10Q9NW15 660 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ZNF543Q08ER8 600 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 LUZP1Q86V48 1076 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 HOMER1Q86YM7 354 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 FERMT2Q96AC1 680 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 PIGSQ96S52 555 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 SPECC1Q5M775 1068 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 MKL1Q969V6 931 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 NYAP2Q9P242 653 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 MYH4Q9Y623 1939 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 NAPAP54920 295 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 CSRNP2Q9H175 543 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ATP2B2Q01814 1243 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 HS1BP3Q53T59 392 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 ADCY5O95622 1261 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 CXCL9Q07325 125 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 PTGDRQ13258 359 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CTU2-210ENST00000567949 LONRF3Q496Y0 759 aa23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms