RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 PRDM1O75626 825 aa25.01■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.01■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 MROH8Q9H579 483 aa25.01■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.01■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 CYP2C19P33261 490 aa25■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 C7orf61Q8IZ16 206 aa25■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.99■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 LHX8Q68G74 356 aa24.99■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 NAPBQ9H115 298 aa24.99■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 NYAP2Q9P242 653 aa24.99■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.98■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.98■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.98■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.98■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 SLC25A27O95847 323 aa24.97■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.97■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.97■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 F5H6K3 240 aa24.96■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 VWA5AO00534 786 aa24.96■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 COBLO75128 1261 aa24.96■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 FCER1AP12319 257 aa24.96■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 PDE4BQ07343 736 aa24.96■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 KLRC3Q07444 240 aa24.96■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.96■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PPP4C-211ENST00000567642 PFASO15067 1338 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 NDUFB10O96000 172 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 STAT3P40763 770 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 EVI5LQ96CN4 794 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 CEP95Q96GE4 821 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 MMP19Q99542 508 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 MSCO60682 206 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 TSPY3P0CV98 308 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 TSPY8P0CW00 308 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 PDE1AP54750 535 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 PPARAQ07869 468 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 TRPV1Q8NER1 839 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 STAP2Q9UGK3 403 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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PPP4C-211ENST00000567642 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.93■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.93■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.93■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 TTLL1O95922 423 aa24.92■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 CYBAP13498 195 aa24.92■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 TFAP4Q01664 338 aa24.92■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 LNPKQ9C0E8 428 aa24.92■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 COL6A1P12109 1028 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 SYN1P17600 705 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 COPB2P35606 906 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 SLC4A3P48751 1232 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 AAMPQ13685 434 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 KCTD2Q14681 263 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 ANO1Q5XXA6 986 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 REPS2Q8NFH8 660 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 MKL1Q969V6 931 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 MAML3Q96JK9 1138 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 IGHA2P01877 340 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 PGK2P07205 417 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 KIFC2Q96AC6 838 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 PRO3102Q9H379 93 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 ZBED4O75132 1171 aa24.89■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 CPXCR1Q8N123 301 aa24.89■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.89■■□□□ 1.58
PPP4C-211ENST00000567642 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.89■■□□□ 1.57
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP4C-211ENST00000567642 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP4C-211ENST00000567642 VPS53Q5VIR6 699 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP4C-211ENST00000567642 SLFN13Q68D06 897 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP4C-211ENST00000567642 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP4C-211ENST00000567642 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP4C-211ENST00000567642 FEM1BQ9UK73 627 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP4C-211ENST00000567642 TSPY2A6NKD2 308 aa24.87■■□□□ 1.57
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