RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	30.25	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	30.25	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A0G2JMZ2	1700 aa		30.25	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		30.24	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	RLF	Q13129	1914 aa		30.24	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	FCER1A	P12319	257 aa		30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	NAPB	Q9H115	298 aa		30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	STAP2	Q9UGK3	403 aa		30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		30.23	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	ALPK3	Q96L96	1907 aa		30.22	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC25A27	O95847	323 aa		30.22	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	30.22	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	MSC	O60682	206 aa		30.21	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	SYN1	P17600	705 aa		30.21	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	NYAP2	Q9P242	653 aa		30.21	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		30.21	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	30.21	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	30.21	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	PFAS	O15067	1338 aa		30.21	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	COBL	O75128	1261 aa		30.2	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	30.2	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	STAT3	P40763	770 aa		30.2	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC4A3	P48751	1232 aa		30.2	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966	MMP19	Q99542	508 aa		30.2	■■■□□ 2.43
PPP4C-208	ENST00000564966		F5H6K3	240 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	VWA5A	O00534	786 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	PDE4B	Q07343	736 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	KLRC3	Q07444	240 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	KCTD2	Q14681	263 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		30.19	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		30.18	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	TSPY3	P0CV98	308 aa		30.18	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	TSPY8	P0CW00	308 aa		30.18	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		30.18	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	30.17	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	PARP14	Q460N5	1801 aa		30.17	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	NDUFB10	O96000	172 aa		30.17	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	CYBA	P13498	195 aa		30.17	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	ANO1	Q5XXA6	986 aa		30.17	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		30.17	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	TRPV1	Q8NER1	839 aa		30.17	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	30.17	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		30.17	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	PPARA	Q07869	468 aa		30.16	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		30.16	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		30.16	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	30.16	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP95	Q96GE4	821 aa		30.16	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	30.16	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	PGK2	P07205	417 aa		30.15	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	COL6A1	P12109	1028 aa		30.15	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	MAML3	Q96JK9	1138 aa		30.15	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		30.15	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	TTLL1	O95922	423 aa		30.14	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	COPB2	P35606	906 aa		30.14	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		30.14	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	30.14	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	KIFC2	Q96AC6	838 aa		30.14	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	EVI5L	Q96CN4	794 aa		30.14	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	PRO3102	Q9H379	93 aa		30.14	■■■□□ 2.42
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBED4	O75132	1171 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	TFAP4	Q01664	338 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	CPXCR1	Q8N123	301 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	MYH4	Q9Y623	1939 aa		30.13	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		30.12	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		30.12	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		30.12	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		30.12	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	KBTBD13	C9JR72	458 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	SEPT4	O43236	478 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	PDE1A	P54750	535 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A1W2PPC1	479 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	DNM1L	O00429	736 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	SLFN13	Q68D06	897 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	REPS2	Q8NFH8	660 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX11	Q96FC9	970 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	LNPK	Q9C0E8	428 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	TSPY2	A6NKD2	308 aa		30.09	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	30.09	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	MKL1	Q969V6	931 aa		30.09	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	30.09	■■■□□ 2.41

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