RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCNA1P78396 465 aa26.13■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRDNQ13061 729 aa26.13■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.13■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COA7Q96BR5 231 aa26.13■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GMCL1Q96IK5 515 aa26.13■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.13■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.13■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEX10O60683 326 aa26.12■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATG4CQ96DT6 458 aa26.12■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.12■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BTBD7Q9P203 1132 aa26.12■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BMP3P12645 472 aa26.11■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAPK4P31152 587 aa26.11■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 Q3C1V9 767 aa26.11■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.11■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DGKHQ86XP1 1220 aa26.11■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLF1Q9BQI6 1058 aa26.11■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.11■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.11■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.11■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC1A4P43007 532 aa26.1■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRKCZQ05513 592 aa26.1■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FEM1BQ9UK73 627 aa26.1■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.1■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 E7EWF7 191 aa26.09■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.09■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PORCNQ9H237 461 aa26.09■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NECTIN1Q15223 517 aa26.08■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCOA7Q8NI08 942 aa26.08■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAET1EQ8TD07 263 aa26.08■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF4Q8WV16 495 aa26.08■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.08■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATC1LQ9H0A9 340 aa26.08■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.08■■□□□ 1.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VWA5AO00534 786 aa26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC27A2O14975 620 aa26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MCCP23508 829 aa26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STAT2P52630 851 aa26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM160B2Q86V87 743 aa26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKS1AQ92625 1134 aa26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GABRQQ9UN88 632 aa26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNKSO95271 1327 aa26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLA2G6O60733 806 aa26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FLT3LGP49771 235 aa26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IRF5Q13568 498 aa26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF20Q5VTR2 975 aa26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPR142Q7Z601 462 aa26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SHCBP1Q8NEM2 672 aa26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOCS4Q8WXH5 440 aa26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM232C9JQI7 657 aa26.05■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLS1Q14651 629 aa26.05■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC96Q2M329 555 aa26.05■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.05■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.05■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLEKHH3Q7Z736 793 aa26.05■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.05■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTMR7Q9Y216 660 aa26.05■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.04■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FDX1P10109 184 aa26.04■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM132BQ14DG7 1078 aa26.04■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCTD1Q719H9 257 aa26.04■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 REPS2Q8NFH8 660 aa26.04■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIFC2Q96AC6 838 aa26.04■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARMC5Q96C12 935 aa26.04■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KAT14Q9H8E8 782 aa26.04■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLXNB2O15031 1838 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 REC8O95072 547 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDHBP11177 359 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COPB2P35606 906 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR78Q5VTH9 848 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLAIN1Q8ND83 568 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PNMA1Q8ND90 353 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GJD2Q9UKL4 321 aa26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.02■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBED4O75132 1171 aa26.02■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC25A27O95847 323 aa26.02■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNHG28P0DPA3 235 aa26.02■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEC23AQ15436 765 aa26.02■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF11Q86T75 865 aa26.02■■□□□ 1.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIOX2Q8IUF8 465 aa26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.3 ms