RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSPA4P34932 840 aa20.52■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 SEC23AQ15436 765 aa20.52■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCTD1Q719H9 257 aa20.52■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATG4CQ96DT6 458 aa20.52■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC1A4P43007 532 aa20.51■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 NT5C2P49902 561 aa20.51■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKS1AQ92625 1134 aa20.51■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.51■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 BTBD7Q9P203 1132 aa20.51■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 GMCL1Q96IK5 515 aa20.5■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.5■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM232C9JQI7 657 aa20.5■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 C8orf34Q49A92 452 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIFC2Q96AC6 838 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM47Q96LD4 638 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 NEK1Q96PY6 1258 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.49■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.49■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ERVK-9P63128 1117 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERVK-24P63145 666 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC96Q2M329 555 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.48■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM17Q9Y577 477 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC16A2P36021 539 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF22Q14807 665 aa20.47■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 PORCNQ9H237 461 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 EFCC1Q9HA90 598 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 FEM1BQ9UK73 627 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 PARP14Q460N5 1801 aa20.47■□□□□ 0.87
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CCNDBP1-204ENST00000563065 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 WTAPQ15007 396 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 LY9Q9HBG7 655 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERICH2A1L162 156 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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CCNDBP1-204ENST00000563065 KRT32Q14532 448 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLS1Q14651 629 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 REPS2Q8NFH8 660 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPVLQ9H3G5 476 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 HTTP42858 3142 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYPNQ86TC9 1320 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 STAT2P52630 851 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 FCGRTP55899 365 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF543Q08ER8 600 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 CENPFP49454 3210 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.43■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.43■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.43■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.43■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.43■□□□□ 0.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 GABRQQ9UN88 632 aa20.43■□□□□ 0.86
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