RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 ERBINQ96RT1 1412 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 SMTNL1A8MU46 457 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 USP17L5A8MUK1 530 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 TULP2O00295 520 aa6.35□□□□□ -1.39
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CAPN3-211ENST00000562199 FAM170AA1A519 330 aa6.34□□□□□ -1.39
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CAPN3-211ENST00000562199 FURINP09958 794 aa6.34□□□□□ -1.39
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CAPN3-211ENST00000562199 CPXCR1Q8N123 301 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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CAPN3-211ENST00000562199 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPN3-211ENST00000562199 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.34□□□□□ -1.39
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CAPN3-211ENST00000562199 RAD50Q92878 1312 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.33□□□□□ -1.4
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CAPN3-211ENST00000562199 UBA7P41226 1012 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 DGKGP49619 791 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 MLECQ14165 292 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 FAM182BQ5T319 152 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 KSR2Q6VAB6 950 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 C14orf80Q86SX3 495 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 OR8H2Q8N162 312 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 ARL10Q8N8L6 244 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPN3-211ENST00000562199 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.33□□□□□ -1.4
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