RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEPT2Q15019 361 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANO1Q5XXA6 986 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 BICD2Q8TD16 824 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEPSINQ96N21 525 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.54■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYTH3O43739 400 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 CABP5Q9NP86 173 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 ME1P48163 572 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 JAG1P78504 1218 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 YEATS4O95619 227 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 GH2P01242 217 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT2P35908 639 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 ICA1Q05084 483 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH4Q9Y623 1939 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPTLC2O15270 562 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 EPS15P42566 896 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRP5P59047 1200 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 UTRNP46939 3433 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF543Q08ER8 600 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPY5RQ15761 445 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 DACT1Q9NYF0 836 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM205CA6NFA0 338 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAP2P40123 477 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC39A14Q15043 492 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAD21O60216 631 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 NR1I2O75469 434 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP2B1P20020 1258 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPAQ15257 358 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR162Q16538 588 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOMER1Q86YM7 354 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCAF4Q8WV16 495 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAMTS3O15072 1205 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAMK4Q16566 473 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC96Q2M329 555 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLFN13Q68D06 897 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADALQ6DHV7 355 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 FSIP1Q8NA03 581 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIGSQ96S52 555 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 GGA3Q9NZ52 723 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFRSF25Q93038 417 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms