RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 SLC25A27O95847 323 aa25.9■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.9■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 LHX8Q68G74 356 aa25.9■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.9■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 CEP290O15078 2479 aa25.9■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 FCER1AP12319 257 aa25.89■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 PDE4BQ07343 736 aa25.89■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.89■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.89■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.89■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 VWA5AO00534 786 aa25.88■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 MSCO60682 206 aa25.88■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.88■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.88■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 F5H6K3 240 aa25.87■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 COBLO75128 1261 aa25.87■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 TSPY3P0CV98 308 aa25.87■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 TSPY8P0CW00 308 aa25.87■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 STAT3P40763 770 aa25.87■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 KLRC3Q07444 240 aa25.87■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 EVI5LQ96CN4 794 aa25.87■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.87■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 MMP19Q99542 508 aa25.86■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.86■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 NDUFB10O96000 172 aa25.85■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 PPARAQ07869 468 aa25.85■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.85■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 CEP95Q96GE4 821 aa25.85■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.85■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 PFASO15067 1338 aa25.85■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.85■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 TTLL1O95922 423 aa25.84■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 COPB2P35606 906 aa25.84■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 PDE1AP54750 535 aa25.84■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 AAMPQ13685 434 aa25.84■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 KCTD2Q14681 263 aa25.84■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.84■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 STAP2Q9UGK3 403 aa25.84■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.83■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 RLFQ13129 1914 aa25.83■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.83■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 CYBAP13498 195 aa25.83■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.83■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 TRPV1Q8NER1 839 aa25.83■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CIPC-208ENST00000557115 COL6A1P12109 1028 aa25.82■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 SLC4A3P48751 1232 aa25.82■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 TFAP4Q01664 338 aa25.82■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 MAML3Q96JK9 1138 aa25.82■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 ZBED4O75132 1171 aa25.81■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 SYN1P17600 705 aa25.81■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.81■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 MKL1Q969V6 931 aa25.81■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 KIFC2Q96AC6 838 aa25.81■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.81■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 LNPKQ9C0E8 428 aa25.81■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 IGHA2P01877 340 aa25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 PGK2P07205 417 aa25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 ANO1Q5XXA6 986 aa25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 REPS2Q8NFH8 660 aa25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 PRO3102Q9H379 93 aa25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.8■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 TSPY2A6NKD2 308 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 SEPT4O43236 478 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 CPXCR1Q8N123 301 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 FEM1BQ9UK73 627 aa25.79■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 DNM1LO00429 736 aa25.78■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 SLFN13Q68D06 897 aa25.78■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.78■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 RILPL2Q969X0 211 aa25.77■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 DDX11Q96FC9 970 aa25.77■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 STX8Q9UNK0 236 aa25.77■■□□□ 1.72
CIPC-208ENST00000557115 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
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