RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555908.5

RIN3-208, Transcript of Ras and Rab interactor 3, human

TSL 5

Gene RIN3, Length 390 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RIN3-208	ENST00000555908	HMGCR	P04035	888 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	GJB1	P08034	283 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	RGS2	P41220	211 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	MTFR1	Q15390	333 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	CAPN2	P17655	700 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	DPF3	Q92784	378 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908		Q3C1V9	767 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RIN3-208	ENST00000555908		A0A1W2PRG0	241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	PRDM1	O75626	825 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	GJA8	P48165	433 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	RPTOR	Q8N122	1335 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	PEX10	O60683	326 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	SGPL1	O95470	568 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	PPARA	Q07869	468 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	APBA2	Q99767	749 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	PORCN	Q9H237	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	HIP1	O00291	1037 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	STRN	O43815	780 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	TTLL1	O95922	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	RASA1	P20936	1047 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	CNGA1	P29973	690 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	TFAP4	Q01664	338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	NUCB1	Q02818	461 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	MROH8	Q9H579	483 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	ZBED4	O75132	1171 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	SLC25A27	O95847	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	IGHD	P01880	384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	PTPRE	P23469	700 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908		F5H6K3	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	FCER1A	P12319	257 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	ERCC3	P19447	782 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	COPB2	P35606	906 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	KLRC3	Q07444	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RIN3-208	ENST00000555908	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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