RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	GABRQ	Q9UN88	632 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	HTT	P42858	3142 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	SRRD	Q9UH36	339 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	GNRH1	P01148	92 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	PRKCZ	Q05513	592 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	MGAM	O43451	1857 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TPCN1-222	ENST00000552897	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	MCC	P23508	829 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	KRT23	Q9C075	422 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		28.51	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	PARP14	Q460N5	1801 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	MYPN	Q86TC9	1320 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897		E7EWF7	191 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	NECTIN1	Q15223	517 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	MTMR7	Q9Y216	660 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	BMP3	P12645	472 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	CASC1	Q6TDU7	716 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	GMCL1	Q96IK5	515 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	TTC14	Q96N46	770 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC27A2	O14975	620 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	HOXD10	P28358	340 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	NT5C2	P49902	561 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	REPS2	Q8NFH8	660 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	GJD2	Q9UKL4	321 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A0G2JMZ2	1700 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	VWA5A	O00534	786 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC1A4	P43007	532 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	FLT3LG	P49771	235 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	PRMT2	P55345	433 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	KCTD1	Q719H9	257 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	DGKH	Q86XP1	1220 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKS1A	Q92625	1134 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM232	C9JQI7	657 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	IQCA1	Q86XH1	822 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	MB21D1	Q8N884	522 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	COA7	Q96BR5	231 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	TNKS	O95271	1327 aa		28.45	■■■□□ 2.15
TPCN1-222	ENST00000552897	GPR142	Q7Z601	462 aa		28.45	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	FEM1B	Q9UK73	627 aa		28.45	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	CAPN15	O75808	1086 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	MAPK4	P31152	587 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	TRDN	Q13061	729 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	SEC23A	Q15436	765 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	KIFC2	Q96AC6	838 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	ANTXR2	P58335	489 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	CCNA1	P78396	465 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	PLS1	Q14651	629 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	CHST3	Q7LGC8	479 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	NCOA7	Q8NI08	942 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	RAET1E	Q8TD07	263 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	DCAF4	Q8WV16	495 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	PDHB	P11177	359 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	ARMC5	Q96C12	935 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	SENP2	Q9HC62	589 aa		28.42	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	PLXNB2	O15031	1838 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	SNHG28	P0DPA3	235 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	ERCC3	P19447	782 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC96	Q2M329	555 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	MORN1	Q5T089	497 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	RASEF	Q8IZ41	740 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	USP6NL	Q92738	828 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	IRF5	Q13568	498 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR78	Q5VTH9	848 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	PNMA1	Q8ND90	353 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	PLA2G6	O60733	806 aa		28.39	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	ELN	P15502	786 aa		28.39	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC16A2	P36021	539 aa		28.39	■■■□□ 2.14
TPCN1-222	ENST00000552897	STAT3	P40763	770 aa		28.39	■■■□□ 2.14

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