RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 CNMDO75829 334 aa26.49■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 BMP3P12645 472 aa26.49■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 KIF22Q14807 665 aa26.49■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.49■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.49■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 PSMC4P43686 418 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 ANTXR2P58335 489 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 SEC23AQ15436 765 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 LBX2Q6XYB7 198 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 ATG4CQ96DT6 458 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 GMCL1Q96IK5 515 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 USP26Q9BXU7 913 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 BTBD7Q9P203 1132 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.48■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 RLFQ13129 1914 aa26.47■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 HSPA4P34932 840 aa26.47■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 SLC1A4P43007 532 aa26.47■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.47■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 KCNB2Q92953 911 aa26.47■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 EFCC1Q9HA90 598 aa26.47■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.47■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 TRIM17Q9Y577 477 aa26.47■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 ERVK-9P63128 1117 aa26.46■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 ERVK-24P63145 666 aa26.46■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 KCTD1Q719H9 257 aa26.46■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.46■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.46■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 MYPNQ86TC9 1320 aa26.45■■□□□ 1.83
BRF1-216ENST00000550208 TMEM232C9JQI7 657 aa26.45■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.45■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 DCAF4Q8WV16 495 aa26.45■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 TRIM47Q96LD4 638 aa26.45■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 SLF1Q9BQI6 1058 aa26.45■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 KAT14Q9H8E8 782 aa26.45■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 SENP2Q9HC62 589 aa26.45■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 FEM1BQ9UK73 627 aa26.45■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 ARHGEF6Q15052 776 aa26.44■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 PNMA1Q8ND90 353 aa26.44■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.44■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 NEK1Q96PY6 1258 aa26.44■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.44■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.44■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 PRC1O43663 620 aa26.43■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 PDHBP11177 359 aa26.43■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 MCM5P33992 734 aa26.43■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 FCGRTP55899 365 aa26.43■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 CCDC96Q2M329 555 aa26.43■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 VWA5AO00534 786 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 MB21D1Q8N884 522 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 KIFC2Q96AC6 838 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 PORCNQ9H237 461 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.42■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 ERICH2A1L162 156 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 SEC24BO95487 1268 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 SNHG28P0DPA3 235 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 KRT32Q14532 448 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 TMEM132BQ14DG7 1078 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 WTAPQ15007 396 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 PARP14Q460N5 1801 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 PLA2G6O60733 806 aa26.4■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 FAM160B2Q86V87 743 aa26.4■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 REPS2Q8NFH8 660 aa26.4■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.4■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 GNRH1P01148 92 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 SLC16A2P36021 539 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 STAT2P52630 851 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 ZNF543Q08ER8 600 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 PLS1Q14651 629 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 MTA3Q9BTC8 594 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 SPATC1LQ9H0A9 340 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.39■■□□□ 1.82
BRF1-216ENST00000550208 ZBED4O75132 1171 aa26.38■■□□□ 1.81
BRF1-216ENST00000550208 HOXD10P28358 340 aa26.38■■□□□ 1.81
BRF1-216ENST00000550208 CCNA1P78396 465 aa26.38■■□□□ 1.81
BRF1-216ENST00000550208 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
BRF1-216ENST00000550208 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.38■■□□□ 1.81
BRF1-216ENST00000550208 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms