RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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PTPRQ-204ENST00000549355 ABCC5O15440 1437 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRQ-204ENST00000549355 GALK1P51570 392 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRQ-204ENST00000549355 SULF2Q8IWU5 870 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 KCT2Q8NC54 265 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 FBRSQ9HAH7 460 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 C3P01024 1663 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRQ-204ENST00000549355 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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