RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 MMP19Q99542 508 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 ALPK3Q96L96 1907 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC25A27O95847 323 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 PGK2P07205 417 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 KCTD2Q14681 263 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 GPR153Q6NV75 609 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 GPATCH3Q96I76 525 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 MAML3Q96JK9 1138 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 STAT3P40763 770 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC4A3P48751 1232 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 FERMT2Q96AC1 680 aa14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 VWA5AO00534 786 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 DLL1O00548 723 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 IGHA2P01877 340 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 APPP05067 770 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2-205ENST00000549039 RARBP10826 455 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 TDO2P48775 406 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 TRIM60Q495X7 471 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 TINF2Q9BSI4 451 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRC41Q15345 812 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 APPBP2Q92624 585 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 OSBP2Q969R2 916 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM161BQ96MY7 647 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 F5H6K3 240 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 GPAA1O43292 621 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 PRDM1O75626 825 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 PGK1P00558 417 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 RASA1P20936 1047 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 COPB2P35606 906 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 KLRC3Q07444 240 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 SBK1Q52WX2 424 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 RNF180Q86T96 592 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 CPXCR1Q8N123 301 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 BADQ92934 168 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 DDX11Q96FC9 970 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ZBED4O75132 1171 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 NDUFB10O96000 172 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 GNAT2P19087 354 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 KIFC2Q96AC6 838 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 DCTPP1Q9H773 170 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 NYAP2Q9P242 653 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 M0R2C6 588 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 AKR1A1P14550 325 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 REPS2Q8NFH8 660 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A0C4DFX4 3053 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 TLE2Q04725 743 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 SNX17Q15036 470 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 SHHQ15465 462 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms