RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	MROH8	Q9H579	483 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	BAG3	O95817	575 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	PGK2	P07205	417 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	AKR1A1	P14550	325 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	PLCG2	P16885	1265 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	DSG3	P32926	999 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	CYP2C18	P33260	490 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	COG5	Q9UP83	839 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ELP1	O95163	1332 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	CD4	P01730	458 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	FGB	P02675	491 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	NHLH1	Q02575	133 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ARVCF	O00192	962 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ADCY6	O43306	1168 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	FCER1A	P12319	257 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	SHMT1	P34896	483 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	SEPT2	Q15019	361 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	EHD4	Q9H223	541 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	PLS1	Q14651	629 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	APBB1	O00213	710 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	ASGR1	P07306	291 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	HLA-C	Q95604	372 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	MMP19	Q99542	508 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-208	ENST00000547298		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	CTAGE5	O15320	804 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	PLCD1	P51178	756 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	SLC25A27	O95847	323 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	CA3	P07451	260 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	EVX2	Q03828	476 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	GABPA	Q06546	454 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	LPXN	O60711	386 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	FLOT1	O75955	427 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	CCL23	P55773	120 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	GJA9	P57773	515 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	NKX3-2	P78367	333 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	TRANK1	O15050	2925 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	MYH1	P12882	1939 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CS-208	ENST00000547298	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2

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