RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 DSTYKQ6XUX3 929 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 OTUD6AQ7L8S5 288 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SKA1Q96BD8 255 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.869e-7■■□□□ 13.8
JMJD1C-210ENST00000542921 BHMT2Q9H2M3 363 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KRT82Q9NSB4 513 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 DDAH1O94760 285 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 MAP2K2P36507 400 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 DEFA3P59666 94 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 BFSP2Q13515 415 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TYW1BQ6NUM6 668 aa3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D5Q92609 795 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D32Q96NH3 1257 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 STXBP2Q15833 593 aa3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 OMA1Q96E52 524 aa3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 KANSL1LA0AUZ9 987 aa3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.864e-7■■□□□ 13.1
JMJD1C-210ENST00000542921 JADE1Q6IE81 842 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 C8orf74Q6P047 294 aa3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC185Q8N715 623 aa3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 PRDM10Q9NQV6 1147 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 NBPF15Q8N660 670 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 SPATA5Q8NB90 893 aa3.45□□□□□ -1.86
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JMJD1C-210ENST00000542921 NPHS2Q9NP85 383 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa3.45□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.44□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 GNB5O14775 395 aa3.44□□□□□ -1.86
JMJD1C-210ENST00000542921 TTI1O43156 1089 aa3.44□□□□□ -1.86
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