RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 FAM83BQ5T0W9 1011 aa13.56□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.56□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 TBC1D10CQ8IV04 446 aa13.56□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 NYAP2Q9P242 653 aa13.56□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.55□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 IKQ13123 557 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 SLC39A7Q92504 469 aa13.54□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF3Q9H094 633 aa13.54□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 HOXC10Q9NYD6 342 aa13.54□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.54□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa13.54□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 TACC3Q9Y6A5 838 aa13.54□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 NEDD4P46934 1319 aa13.54□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 PARP14Q460N5 1801 aa13.53□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.53□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 SLC4A3P48751 1232 aa13.53□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 PRMT2P55345 433 aa13.53□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 KLRC3Q07444 240 aa13.53□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF11Q86T75 865 aa13.53□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 SH3TC2Q8TF17 1288 aa13.53□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 STAG1Q8WVM7 1258 aa13.53□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 ESR2Q92731 530 aa13.53□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.53□□□□□ -0.24
UBASH3B-208ENST00000533451 METRNQ9UJH8 293 aa13.53□□□□□ -0.24
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UBASH3B-208ENST00000533451 FLT3LGP49771 235 aa13.52□□□□□ -0.25
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UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC96Q2M329 555 aa13.52□□□□□ -0.25
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UBASH3B-208ENST00000533451 SLF1Q9BQI6 1058 aa13.52□□□□□ -0.25
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UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.52□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 PORCNQ9H237 461 aa13.52□□□□□ -0.25
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UBASH3B-208ENST00000533451 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa13.52□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 B4E1Z4 1266 aa13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 C7P10643 843 aa13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 ELNP15502 786 aa13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 MCCP23508 829 aa13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC1A4P43007 532 aa13.51□□□□□ -0.25
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UBASH3B-208ENST00000533451 Q3C1V9 767 aa13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.51□□□□□ -0.25
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UBASH3B-208ENST00000533451 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 KRT23Q9C075 422 aa13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 BTBD7Q9P203 1132 aa13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 RLFQ13129 1914 aa13.51□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 PLXNB2O15031 1838 aa13.5□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.5□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 ADCY3O60266 1144 aa13.5□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 CNMDO75829 334 aa13.5□□□□□ -0.25
UBASH3B-208ENST00000533451 BMP3P12645 472 aa13.5□□□□□ -0.25
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