RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 MAPK4P31152 587 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 Q3C1V9 767 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 MAP4K1Q92918 833 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 NOVP48745 357 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 PRKCZQ05513 592 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 IQCA1Q86XH1 822 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 ATG4CQ96DT6 458 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 B4E1Z4 1266 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 KDM4AO75164 1064 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 TRDNQ13061 729 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 NBPF11Q86T75 865 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 TTC14Q96N46 770 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 BTBD7Q9P203 1132 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 CYP21A2P08686 494 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 BMP3P12645 472 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 FEM1BQ9UK73 627 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 GABRQQ9UN88 632 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 SLC1A4P43007 532 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 FLT3LGP49771 235 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 GMCL1Q96IK5 515 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 PORCNQ9H237 461 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 PLS1Q14651 629 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 WDR78Q5VTH9 848 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM47Q9BQJ4 181 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 MCCP23508 829 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 IRF5Q13568 498 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 GPR142Q7Z601 462 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 DGKHQ86XP1 1220 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 ARMC5Q96C12 935 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 MTMR7Q9Y216 660 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 PLXNB2O15031 1838 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-222ENST00000532751 VWA5AO00534 786 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 GRK4P32298 578 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 DCAF4Q8WV16 495 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM232C9JQI7 657 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 STAT2P52630 851 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 FAM160B2Q86V87 743 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 NCOA7Q8NI08 942 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 KIFC2Q96AC6 838 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 E7EWF7 191 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 ADCY3O60266 1144 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 ZBED4O75132 1171 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 SLC25A27O95847 323 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC96Q2M329 555 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 GJD2Q9UKL4 321 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 PLA2G6O60733 806 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 FDX1P10109 184 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 KCTD1Q719H9 257 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF333Q96JL9 665 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 MROH8Q9H579 483 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 KAT14Q9H8E8 782 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 TNKSO95271 1327 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 ERCC3P19447 782 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 COPB2P35606 906 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 STAT3P40763 770 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 UBXN2AP68543 259 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 ANKS1AQ92625 1134 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 CYP2B6P20813 491 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRK-222ENST00000532751 PTPREP23469 700 aa25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms