RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ATE1O95260 518 aa8.76□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 PDE6BP35913 854 aa8.76□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.76□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.76□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 EBF1Q9UH73 591 aa8.76□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.76□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 NUAK1O60285 661 aa8.75□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 GREM1O60565 184 aa8.75□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 PSPNO60542 156 aa8.74□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
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SGCE-211ENST00000522045 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.74□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.74□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.74□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 BCL11AQ9H165 835 aa8.74□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.74□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 DLG4P78352 724 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 SHISA4Q96DD7 197 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 TCTN2Q96GX1 697 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 TCFL5Q9UL49 500 aa8.73□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 MAP6Q96JE9 813 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 GGT7Q9UJ14 662 aa8.72□□□□□ -1.01
SGCE-211ENST00000522045 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 OR14I1A6ND48 311 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 CRKP46108 304 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 SLC14A2Q15849 920 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 NLRX1Q86UT6 975 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.71□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 CLEC3AO75596 197 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 CCNFP41002 786 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 GALK1P51570 392 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 SEZ6Q53EL9 994 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 LILRA6Q6PI73 481 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 ATG4CQ96DT6 458 aa8.7□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 NOTOA8MTQ0 251 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 SIGLEC6O43699 453 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 NRDCO43847 1150 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF1O95521 474 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 SYPP08247 313 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 APOBRQ0VD83 1088 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 ADGRF1Q5T601 910 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 GK5Q6ZS86 529 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 GIPC2Q8TF65 315 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 UBP1Q9NZI7 540 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.69□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 TMEM82A0PJX8 343 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 FKTNO75072 461 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 BBS9Q3SYG4 887 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.68□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 MCM4P33991 863 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 ZNF165P49910 485 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 CLCQ05315 142 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.67□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.66□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 HRKO00198 91 aa8.66□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 EFEMP2O95967 443 aa8.66□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 INHBBP09529 407 aa8.66□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 SGPP1Q9BX95 441 aa8.66□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 GCM1Q9NP62 436 aa8.66□□□□□ -1.02
SGCE-211ENST00000522045 CHST7Q9NS84 486 aa8.66□□□□□ -1.02
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