RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 SEPT4O43236 478 aa24.98■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.98■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 MAML3Q96JK9 1138 aa24.98■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.97■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 IGHA2P01877 340 aa24.97■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.97■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.97■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.97■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 MMP19Q99542 508 aa24.97■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.97■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 RTP1P59025 263 aa24.96■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 KCTD2Q14681 263 aa24.96■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 DEFB123Q8N688 67 aa24.96■■□□□ 1.59
PABPC1-218ENST00000521865 APPP05067 770 aa24.95■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 STAT3P40763 770 aa24.95■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 GPR153Q6NV75 609 aa24.95■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.95■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.95■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 APPBP2Q92624 585 aa24.95■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.95■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.94■■□□□ 1.58
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PABPC1-218ENST00000521865 PGK2P07205 417 aa24.94■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 TDO2P48775 406 aa24.94■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 SBK1Q52WX2 424 aa24.94■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 Q7L0L9 218 aa24.94■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 OSBP2Q969R2 916 aa24.94■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 DCTPP1Q9H773 170 aa24.94■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.94■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.94■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.93■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.93■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 GPAA1O43292 621 aa24.92■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 RASA1P20936 1047 aa24.92■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 COPB2P35606 906 aa24.92■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.92■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.92■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 MYH8P13535 1937 aa24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 GNAT2P19087 354 aa24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 SLC4A3P48751 1232 aa24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 FERMT2Q96AC1 680 aa24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 NYAP2Q9P242 653 aa24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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PABPC1-218ENST00000521865 F5H6K3 240 aa24.9■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 RARBP10826 455 aa24.9■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 KLRC3Q07444 240 aa24.9■■□□□ 1.58
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PABPC1-218ENST00000521865 TINF2Q9BSI4 451 aa24.9■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.9■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.9■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.9■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.89■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 PRDM1O75626 825 aa24.89■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 TRIM60Q495X7 471 aa24.89■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.89■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PABPC1-218ENST00000521865 M0R2C6 588 aa24.88■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 NDUFB10O96000 172 aa24.88■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.88■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 REPS2Q8NFH8 660 aa24.88■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 DDX11Q96FC9 970 aa24.88■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.88■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.88■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 ZBED4O75132 1171 aa24.87■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 RNF180Q86T96 592 aa24.87■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 CPXCR1Q8N123 301 aa24.87■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.87■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 ERC2O15083 957 aa24.86■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.86■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 KIFC2Q96AC6 838 aa24.86■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.86■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 MYH7P12883 1935 aa24.86■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 PGK1P00558 417 aa24.85■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 FSD1Q9BTV5 496 aa24.85■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.85■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 TSPY3P0CV98 308 aa24.84■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 TSPY8P0CW00 308 aa24.84■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 AKR1A1P14550 325 aa24.84■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PABPC1-218ENST00000521865 CEP95Q96GE4 821 aa24.84■■□□□ 1.57
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