RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	IFNAR1	P17181	557 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TXLNA	P40222	546 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC19A1	P41440	591 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LIFR	P42702	1097 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PLCD1	P51178	756 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GNG11	P61952	73 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SH3BP2	P78314	561 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ST5	P78524	1137 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NR1H3	Q13133	447 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CUL4B	Q13620	913 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE3C	Q15386	1083 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GORAB	Q5T7V8	394 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ISM2	Q6H9L7	571 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PI16	Q6UXB8	463 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF511	Q8NB15	262 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CNNM3	Q8NE01	707 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SMARCE1	Q969G3	411 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	EXOC4	Q96A65	974 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX58	Q96C10	678 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM87B	Q96K49	555 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	EPC1	Q9H2F5	836 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RAI14	Q9P0K7	980 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB21	Q9UL25	225 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RGPD5	Q99666	1765 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC151	A5D8V7	595 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RPS6KA5	O75582	802 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MMP1	P03956	469 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO45	P0C2W1	286 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PDE6A	P16499	860 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MCAM	P43121	646 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RCAN1	P53805	252 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	WNT7B	P56706	349 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GRIN1	Q05586	938 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TCIRG1	Q13488	830 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TUBB2A	Q13885	445 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	MTF1	Q14872	753 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	POSTN	Q15063	836 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	AGER	Q15109	404 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX35	Q5T0J7	233 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB33	Q86T24	672 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NEK11	Q8NG66	645 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA1	Q92805	767 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXJ1	Q92949	421 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	PHKB	Q93100	1093 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	DESI2	Q9BSY9	194 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	DACH1	Q9UI36	760 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC23	Q9UJX2	597 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		5.66	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	LRP5	O75197	1615 aa		5.66	□□□□□ -1.5

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