RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZMYM6	O95789	1325 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MET	P08581	1390 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A1B0GVG6	124 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	FIBP	O43427	364 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ECE2	O60344	883 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	GNAI2	P04899	355 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	INPP5B	P32019	993 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SCTR	P47872	440 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDE4B	Q07343	736 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADAM9	Q13443	819 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RINL	Q6ZS11	566 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	INIP	Q9NRY2	104 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	NENF	Q9UMX5	172 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	USP6	P35125	1406 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159		F8VZ95	297 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	NRDC	O43847	1150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATP4A	P20648	1035 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	DRD4	P21917	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CTAG1A	P78358	180 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMED1	Q13445	227 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MORC3	Q14149	939 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	QPCT	Q16769	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TEX9	Q8N6V9	391 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CUL5	Q93034	780 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNAJC7	Q99615	494 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIM64B	A6NI03	449 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZSCAN12	O43309	604 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC8A1	P32418	973 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYBPC2	Q14324	1141 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	GATA6	Q92908	595 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	IFNK	Q9P0W0	207 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	OPLAH	O14841	1288 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	YEATS4	O95619	227 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	LIFR	P42702	1097 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	HERVK_113	P62684	666 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CYP4A11	Q02928	519 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	USP41	Q3LFD5	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANO9	A1A5B4	782 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRPC1	P48995	793 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	MTF1	Q14872	753 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPCS2	Q15005	226 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLC38A9-222	ENST00000515159	SNCB	Q16143	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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