RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
FAAP20-215ENST00000514625 MAPK4P31152 587 aa21.08■□□□□ 0.97
FAAP20-215ENST00000514625 SLC1A4P43007 532 aa21.08■□□□□ 0.97
FAAP20-215ENST00000514625 NOVP48745 357 aa21.08■□□□□ 0.97
FAAP20-215ENST00000514625 RAET1EQ8TD07 263 aa21.08■□□□□ 0.97
FAAP20-215ENST00000514625 PEX10O60683 326 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 BMP3P12645 472 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 Q3C1V9 767 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 ATG4CQ96DT6 458 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 GMCL1Q96IK5 515 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 FEM1BQ9UK73 627 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 MYH4Q9Y623 1939 aa21.07■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 CNMDO75829 334 aa21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 MCCP23508 829 aa21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 PLS1Q14651 629 aa21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 DGKHQ86XP1 1220 aa21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 BTBD7Q9P203 1132 aa21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.05■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 E7EWF7 191 aa21.05■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 PRKCZQ05513 592 aa21.05■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.05■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 WDR78Q5VTH9 848 aa21.05■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF11Q86T75 865 aa21.05■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 NCOA7Q8NI08 942 aa21.05■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 MTMR7Q9Y216 660 aa21.05■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM232C9JQI7 657 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 FLT3LGP49771 235 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 RNF20Q5VTR2 975 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 DCAF4Q8WV16 495 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 PORCNQ9H237 461 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.04■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 VWA5AO00534 786 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 ZBED4O75132 1171 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 CAPN15O75808 1086 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 STAT2P52630 851 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC96Q2M329 555 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 FAM160B2Q86V87 743 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 KIFC2Q96AC6 838 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 KAT14Q9H8E8 782 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 GABRQQ9UN88 632 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 TNKSO95271 1327 aa21.03■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 SLC27A2O14975 620 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 FDX1P10109 184 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 NECTIN1Q15223 517 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 IFFO2Q5TF58 517 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 KCTD1Q719H9 257 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 GPR142Q7Z601 462 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 ANKS1AQ92625 1134 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 MGAMO43451 1857 aa21.02■□□□□ 0.96
FAAP20-215ENST00000514625 ERICH2A1L162 156 aa21.01■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 PLA2G6O60733 806 aa21.01■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 REC8O95072 547 aa21.01■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 IRF5Q13568 498 aa21.01■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.01■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.01■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 MROH8Q9H579 483 aa21.01■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 ADCY3O60266 1144 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 SLC25A27O95847 323 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 GRK4P32298 578 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 COPB2P35606 906 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 STAT3P40763 770 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 STOX1Q6ZVD7 989 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 SLAIN1Q8ND83 568 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 PNMA1Q8ND90 353 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 ARMC5Q96C12 935 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 GJD2Q9UKL4 321 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21■□□□□ 0.95
FAAP20-215ENST00000514625 RLFQ13129 1914 aa21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.6 ms